小儿自闭症是怎么引起的？可能与基因异常有关。
如果我们把人体比做一个工厂，那么基因就是我们身体里面制造产品的模具，人体里的每个细胞里一共有大约三万个这样的模具（基因），每天大量生产维系我们生存和健康的各种产品（蛋白质）。而维系我们人类的精神智力行为健康的基因（模具）接近两万个，其中的某一个或几个基因出现了问题，都可能导致婴儿出现精神智力和行为方面的异常，其中可能就包括自闭症。
如果基因（模具）正常，就能生产出合格的产品（蛋白质），孩子的身体就健康，如果父亲或母亲的基因有问题，生产出来的产品就差，孩子的身体就不健康。当然除了基因之外，生产产品的原料（也就是怀孕母亲的营养）质量不好、或者制造过程（怀孕母亲接触的环境）故障，也可能导致产品最终出现问题。
小儿自闭症是怎么引起的呢？对自闭症病因的科学研究，主要集中查找基因异常以及与基因异常有关的环境因素。近十年来的确在基因方面有了重大发现，在大约15%的自闭症患者的身体细胞里找到了基因异常，这些均表明遗传因素（染色体遗传、基因突变）在自闭症病因学方面有重要地位。当然，这些找到了基因异常的自闭症，主要还是一些症状性自闭症，比如脆性X染色体综合征、雷特综合征、结节性硬化。而多数自闭症（尤其是经典自闭症）在基因异常方面的研究很不一致，有些学者说发现了异常，但别人的研究却不能证实，意见分歧很大。
小儿自闭症是怎么引起的呢？目前基因异常的查找工作在紧锣密鼓地进行着。有些学者认为在短短几十年时间里，自闭症发病率增长得这么快，无法用遗传基因因素解释，应该还有外界环境因素，比如孕期前父母的健康状况（会影响精子和卵子的健康）、怀孕后的宫内环境和生后早期的接触到的环境因素，尤其是病毒感染、电磁放射线辐射、肠道菌群、农业杀虫剂污染的食物、空气污染、日常生活中的化学品等，认为这些因素可能直接或间接影响了自闭症的发生。但遗憾的是，截至目前还没有确定任何一个环境因素是自闭症的起因。